Pathfinder Adventures позволила игрокам посмотреть на события Второй Войны как со стороны Орды, так и со стороны Альянса. Однако, в отличие от первой игры Orcs & Humans, канонической считается именно кампания Альянса.
Сюжет, как и ранее, был представлен в виде брифингов перед миссиями, а иногда показывали короткие ролики.