В игре Halcyon 6: Starbase Commander нет дерева технологий, вместо этого дается выбор из трех направлений исследований: инженерия, социология, физика. Каждое направление исследования возглавляет лидер ученый.
В каждом направлении дается список возможных для исследований технологий. Они объединяются в каждом на различные группы, например: производство, технологии, покорение космоса, военные и т.д.
Так же эти технологии различаются на две категории: обычные – выпадают в соответствии исследований и доступны последовательно, редкие – обычно выпадают очень редко и только в соответствии параметров расы, иногда так же появляются после определенных игровых событиях.
Кроме того в игре так же становятся доступными отдельные исследования. Обычно это исследование аномалий или новых встреченных существ.